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制備型/半制備液相色譜柱的系統由儲液器、泵、進樣器、色譜柱、檢測器、記錄儀等幾部分組成。儲液器中的流動相被高壓泵打入系統,樣品溶液經進樣器進入流動相,被流動相載入色譜柱(固定相) 內, 由于樣品溶液中的各組分在兩相中具有不同的分配系數, 在兩相中作相對運動時, 經過反復多次的吸附- 解吸的分配過程, 各組分在移動速度上產生較大的差別, 被分離成單個組分依次從柱內流出, 通過檢測器時, 樣品濃度被轉換成電信號傳送到記錄儀,數據以圖譜形式打印出來。
制備型/半制備液相色譜柱的使用和維護：
在日常分離分析工作中，色譜柱的正確使用和維護十分重要，色譜柱使用是否得當，直接影響色譜柱的壽命，稍有不慎就會降低柱效、縮短使用壽命甚至損壞。在色譜操作過程中，需要注意下列問題，以維護色譜柱。
（1） 柱子在裝卸、更換時，動作要輕，接頭擰緊要適度。必須防止較強的機械振動，以免柱床產生空隙。
（2） 如果儀器用來做常規分析，樣品種類有限，但分析次數多，則不妨為每一類常規分析配置一根柱，這樣有助于延長柱子的壽命。
（3） 避免壓力和溫度的急劇變化及任何機械震動。溫度的突然變化或者使色譜柱從高處掉下都會影響柱內的填充狀況;柱壓的突然升高或降低也會沖動柱內填料，因此在調節流速時應該緩慢進行，在閥進樣時閥的轉動不能過緩。
（4） 應逐漸改變溶劑的組成，特別是反相色譜中，不應直接從有機溶劑改變為全部是水，反之亦然。
（5） 如使用柱溫控制裝置時，應注意在通人流動相后才能升溫。
（6） 一般說來色譜柱不能反沖，只有生產者指明該柱可以反沖時，才可以反沖除去留在柱頭的雜質。否則反沖會迅速降低柱效。
（7） 選擇使用適宜的流動相，以避免固定相被破壞。有時可以在進樣器前面連接一個預柱，分析柱是鍵合硅膠時，預柱為硅膠，可使流動相在進入分析柱之前預先被硅膠“飽和"，避免分析柱中的硅膠基質被溶解。
（8） 避免將基質復雜的樣品尤其是生物樣品直接注人柱內，需要對樣品進行預處理或者在進樣器和色譜柱之間連接一個保護柱。保護柱一般是填有相似固定相的短柱。保護柱可以而且應該經常更換。
（9） 經常用強溶劑沖洗色譜柱，清除保留在柱內的雜質。在進行清洗時，對流路系統中流動相的置換應以相混溶的溶劑逐漸過渡，每種流動相的體積應是柱體積的20倍左右，即常規分析需要50-75mL。
（10） 保存色譜柱時應將柱內充滿乙腈或甲醇，柱接頭要擰緊，防止溶劑揮發干燥。禁止將緩沖溶液留在柱內靜置過夜或更長時間。
（11） 色譜柱使用過程中，如果壓力升高，一種可能是燒結濾片被堵塞，這時應更換濾片或將其取出進行清洗；另一種可能是大分子進人柱內，使柱頭被污染;如果柱效降低或色譜峰變形，則可能柱頭出現塌陷，死體積增大。
（12） 在完成分離分析工作之后，不應立即停機，需及時對色譜分析系統進行沖洗，一般0.5h以上，以除去色譜柱內的雜質。
使用注意：
拿到一根新柱時，一定要先看其使說明，然后測柱效，定期檢測柱效， 保留在新色譜柱上得到的色譜圖，并記錄條件， 定期檢測儀器的譜帶展寬。 若應用于在線監測， 應對色譜柱提供在線的物理保護和化學保護， 例如采取安裝在線過濾器， 自裝填料保護柱和預裝保護柱等。在線過濾器的作用是防止顆粒在柱頭累計，優點是基本不影響柱效， 在需要高柱效的時候常用， 常更換的消耗品是濾芯和墊圈保護柱的作用是防止柱子被化學污染。 缺點是多數保護柱影響色譜柱的柱效， 特別是在用微柱時，常用的是普通 自裝填料的保護柱。
